Quels outils pour bien gérer les finances d’une startup en 2025 ?

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Gérer les finances d’une startup ne se résume plus à tenir un simple tableau Excel. En 2025, les outils numériques offrent des solutions performantes et interconnectées pour piloter efficacement la trésorerie, automatiser les tâches chronophages et assurer une bonne conformité fiscale. Voici une sélection d’outils utiles pour les jeunes entreprises souhaitant mieux structurer leur gestion financière.

1. Ouvrir un compte professionnel adapté aux startups

Avant même de choisir vos outils, bien sélectionner votre compte professionnel et votre banque pour startup peut faire toute la différence, le compte bancaire professionnel est le point de départ de toute bonne organisation financière. Il permet de :

  • Séparer clairement les finances personnelles et professionnelles, pour éviter toute confusion comptable et faciliter les obligations fiscales.
  • Recevoir les paiements clients, encaisser des virements ou émettre des factures.
  • Payer les fournisseurs, les charges sociales, ou les collaborateurs, avec une traçabilité complète.
  • Bénéficier d’intégrations avec d’autres outils de gestion (facturation, comptabilité, etc.).

Quelques critères pour bien choisir

  • Facilité d’ouverture 100 % en ligne
  • Faibles coûts de gestion
  • Outils de pilotage (notifications, catégorisation des dépenses)
  • Intégrations avec d’autres logiciels (comptabilité, facturation)
  • Détails bancaires en devises (USD, EUR, GBP…) pour encaisser facilement à l’international
  • IBANs internationaux disponibles selon le prestataire

Exemples d’outils :

  • Wise Business : compte multi-devises adapté aux startups qui réalisent des paiements internationaux. Il permet de recevoir des virements en 10 devises sans frais et de se connecter à des outils comme Xero, Fintecture . L'accès à l'ensemble des fonctionnalités se fait sans abonnement mensuel, avec un simple frais unique à l’ouverture.
  • Qonto : compte pro en ligne avec carte bancaire, outils de gestion des dépenses et intégrations comptables. Adapté aux PME qui cherchent à centraliser leur gestion financière, avec plusieurs niveaux d’abonnement selon la taille de l’équipe. Intègre également un module de gestion des notes de frais et de facturation.
  • Shine : adapté aux indépendants et jeunes entreprises avec une interface simple et un support client humain. La plateforme propose aussi des services d’accompagnement administratif (création de statuts, immatriculation, URSSAF, etc.) utiles en début d’activité. Les formules sont proposées sous forme d’abonnements mensuels selon le niveau de service choisi.

2. Mettre en place une solution de facturation et de paiement

Facturer ses clients de manière professionnelle est crucial. Les outils modernes permettent d’automatiser l’envoi des factures, de suivre les paiements et de relancer les retards sans perdre de temps.

Un atout clé pour structurer votre activité

  • Pour professionnaliser la relation client dès les premiers échanges
  • Pour faciliter le suivi des encaissements et relancer rapidement en cas de retard
  • Pour produire des pièces comptables conformes et prêtes à l’export vers l’expert-comptable

Fonctionnalités clés

  • Création de devis et factures conformes
  • Paiement en ligne (CB, virement, prélèvement)
  • Automatisation des relances
  • Export comptable (extraction des données vers un fichier FEC ou Excel pour l’expert-comptable)

Exemples :

  • Henrri : logiciel de facturation 100 % gratuit avec modules optionnels payants. Adapté aux freelances et TPE.
  • Sellsy : CRM + facturation + comptabilité dans une solution tout-en-un. Idéal pour les startups en forte croissance.
  • Pennylane : outil de gestion financière connecté à un expert-comptable. Combine facturation, comptabilité et trésorerie.

3. Adopter une solution de comptabilité automatisée

Une fois la facturation et le compte pro mis en place, il est essentiel d’assurer un suivi comptable régulier. Les outils SaaS permettent d’automatiser une grande partie des écritures comptables et facilitent les échanges avec un expert-comptable. À ce titre, mieux gérer ses abonnements SaaS peut aussi contribuer à optimiser la trésorerie et limiter les coûts superflus.

L’intérêt d’automatiser la comptabilité dès les premières étapes

  • Pour éviter les erreurs ou oublis dans les obligations fiscales
  • Pour avoir une vision à jour des finances de la société
  • Pour préparer les bilans et déclarations fiscales plus sereinement

Fonctionnalités clés

  • Synchronisation bancaire automatique
  • Catégorisation des transactions
  • Export FEC / TVA / bilan
  • Accès collaboratif avec un comptable

Exemples :

  • Indy : outil pensé pour les indépendants et microentreprises, automatisé et sans jargon. Compatible avec les régimes fiscaux français.
  • Axonaut : solution française tout-en-un combinant CRM, facturation et comptabilité. Conçue pour les TPE et startups, elle offre une interface intuitive et des fonctionnalités adaptées aux besoins des petites structures.
  • Sinao : comptabilité simplifiée pour PME avec facturation intégrée. Interface claire et support basé en France.

4. Centraliser les paiements et cartes de l’équipe

À mesure que l’équipe s’agrandit, il devient utile de structurer les dépenses avec des cartes professionnelles.

  • Pourquoi c’est utile pour structurer la croissance
  • Pour suivre les dépenses par collaborateur
  • Pour éviter les avances de frais et les notes manuelles
  • Pour automatiser le rapprochement comptable

Avantages

  • Suivi des dépenses par collaborateur
  • Limites personnalisables
  • Justificatifs attachés aux transactions
  • Synchronisation avec l’outil de comptabilité

Exemples :

  • Spendesk : solution complète de gestion des dépenses avec cartes physiques et virtuelles, centralisation des justificatifs et workflows de validation.
  • Manager.one : banque pro avec cartes configurables, règles automatiques et gestion des notes de frais. Tarification forfaitaire.
  • Pleo : cartes pro avec reporting, catégorisation automatique et outils de contrôle en temps réel.

5. Suivre sa trésorerie et ses indicateurs financiers

En phase de croissance, le pilotage de la trésorerie est essentiel. Les startups doivent anticiper leurs flux, suivre leurs marges et visualiser leurs KPI en temps réel.

Pourquoi surveiller sa trésorerie dès le lancement

  • Pour anticiper les besoins de financement et les dépenses à venir
  • Pour détecter rapidement les retards de paiement
  • Pour justifier sa solidité auprès des investisseurs ou partenaires

Fonctionnalités clés

  • Connexion bancaire et prévisions de trésorerie
  • Tableaux de bord personnalisés
  • Suivi des encours clients/fournisseurs

Exemples :

  • Agicap : suivi de trésorerie connecté aux comptes bancaires et logiciels comptables. Utilisé par de nombreuses PME françaises.
  • Fygr : outil simple pour les PME avec prévisions et scénarios. Possibilité de connecter plusieurs banques.
  • Liveflow : extension Google Sheets connectée à QuickBooks pour automatiser les tableaux de bord financiers.

Gérer les finances d’une startup en 2025 nécessite de choisir les bons outils dès le départ. En combinant un compte pro adapté, une solution de facturation automatisée, une comptabilité connectée et des outils de gestion de trésorerie, vous gagnerez un temps précieux et limiterez les erreurs. Il est également recommandé de privilégier les solutions qui s’intègrent entre elles pour centraliser l’information financière et faciliter la prise de décision.