Un dos bloqué, une opération repoussée depuis le printemps, une grippe qui traîne : à la rentrée, les arrêts de travail reprennent. Pour un micro-entrepreneur, la vraie surprise n'arrive pas chez le médecin, elle arrive au moment du versement. Les indépendants ont bien droit à des indemnités journalières de la Sécurité sociale. Mais sous un revenu annuel moyen de 4 582 €, seuil réévalué chaque année, cette indemnité tombe à zéro.

Comment votre indemnité se calcule, abattement compris

L'Assurance maladie divise par 730 votre revenu d'activité annuel moyen. Ce revenu correspond à la moyenne de vos revenus cotisés des trois années civiles qui précèdent l'arrêt. Pour un micro-entrepreneur, ce n'est pas le chiffre d'affaires encaissé : c'est le chiffre d'affaires diminué de l'abattement forfaitaire propre à votre activité.

Cet abattement atteint 71 % pour la vente de marchandises et 50 % pour les prestations de services commerciales ou artisanales. Il tombe à 34 % pour les activités libérales déclarées en BNC. Un chiffre d'affaires moyen de 30 000 € en prestations de services devient ainsi un revenu de 15 000 €. L'indemnité s'établit alors à 20,55 € par jour.

Le calcul est plafonné des deux côtés. Vos revenus sont retenus dans la limite du plafond annuel de la Sécurité sociale, soit 48 060 € bruts au 1er janvier 2026. Au-delà, l'indemnité journalière ne dépasse jamais 65,84 € bruts, selon l'Assurance maladie. Ces sommes supportent ensuite 6,2 % de CSG et 0,5 % de CRDS. Elles entrent aussi dans l'impôt sur le revenu, sauf quand l'arrêt est lié à une affection de longue durée.

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Le revenu annuel moyen sous lequel vous ne touchez rien

Votre indemnité journalière est égale à 0 € quand votre revenu d'activité annuel moyen des trois années civiles précédentes reste inférieur à 10 % de la moyenne des plafonds de la Sécurité sociale de ces trois années. Pour un arrêt qui commence en 2026, ce seuil s'établit à 4 582 €.

Ce plancher porte sur le revenu après abattement, jamais sur le chiffre d'affaires brut. Il se traduit donc par un niveau d'activité très différent selon ce que vous vendez.

Chiffre d'affaires annuel moyen minimal pour percevoir une indemnité en 2026
ActivitéAbattementChiffre d'affaires
Vente de marchandises (BIC)71 %15 800 €
Prestations de services (BIC)50 %9 164 €
Activité libérale (BNC)34 %6 943 €

Calcul Selectra à partir du seuil de 4 582 € et des taux d'abattement publiés par l'Assurance maladie, août 2026.

Un travailleur non salarié qui démarre, qui a levé le pied ou qui cumule sa micro-entreprise avec un emploi passe facilement sous cette barre. Le calcul portant sur trois années, une bonne année ne rattrape pas toujours deux exercices creux.

Un cas de figure chiffré

Imaginons Julien, coach sportif en micro-entreprise depuis trois ans. Son activité relève des prestations de services, avec un abattement de 50 %. Avec 8 400 € de chiffre d'affaires annuel moyen, son revenu retenu tombe à 4 200 €, sous le seuil de 4 582 €. Un arrêt de dix jours ne lui rapporte rien. À 9 400 € de chiffre d'affaires, son revenu moyen atteint 4 700 € : son indemnité passe à 6,44 € par jour, soit 45,08 € pour les sept jours indemnisés.

Une porte de sortie existe malgré tout. Sous conditions, l'Assurance maladie peut étudier vos droits au titre de votre activité précédente, quel que soit le régime auquel vous étiez affilié. La demande passe par le téléservice « Demande de réétude de dossier indemnités journalières », sur demarches-simplifiees.fr.

Douze mois, trois jours, quarante-huit heures : les règles à respecter

Avant même de parler de montant, trois règles encadrent le versement. Vous devez justifier d'au moins 12 mois d'affiliation continus dans votre activité. Les trois premiers jours de l'arrêt de travail ne sont pas payés. Et vous avez 48 heures pour transmettre l'avis d'arrêt à votre caisse primaire d'assurance maladie.

Ce délai de carence de trois jours connaît deux exceptions utiles. Il saute quand votre arrêt prolonge un arrêt précédent, avec une reprise d'activité de 48 heures au maximum entre les deux. En affection de longue durée, il n'est retenu que pour le premier arrêt, sur une période de trois ans.

La vraie différence avec un salarié se joue ailleurs. Aucun employeur ne maintient votre rémunération, et aucune prévoyance collective ne prend le relais. Les indemnités journalières d'un salarié répondent d'ailleurs à un calcul différent, assis sur les trois derniers salaires bruts.

Tout ce qui précède vaut pour le régime des artisans et commerçants. Les micro-entrepreneurs qui exercent une profession libérale non réglementée depuis 2018 y sont rattachés. Les professions libérales réglementées suivent un barème distinct : indemnité plafonnée à 197,51 € bruts par jour, et durée totale d'arrêt limitée à 90 jours. Les avocats en sont exclus, leur profession disposant déjà d'une couverture obligatoire. Les libéraux non réglementés installés avant 2018, faute d'avoir opté pour le statut d'artisan-commerçant, relèvent eux aussi de ce barème.

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Ce qui existe pour combler le trou pendant l'arrêt

Un contrat de prévoyance individuel sert exactement à cela. Il verse des indemnités journalières qui s'ajoutent à celles de la Sécurité sociale, et couvre également l'invalidité et le décès. Aucun texte ne l'impose à un micro-entrepreneur : la démarche reste volontaire.

Un piège fiscal attend les indépendants au régime micro. Le bénéfice imposable y est déjà calculé après un abattement forfaitaire censé couvrir les charges de l'entreprise. Aucune cotisation de prévoyance ne vient donc s'y déduire en plus, contrairement à un indépendant imposé au réel.

La complémentaire santé d'un auto-entrepreneur répond, elle, à un besoin distinct : elle rembourse les soins, pas la perte de revenus. Les deux contrats se cumulent souvent. Pour situer les tarifs pratiqués, comparez les offres du marché avant de signer.

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Mis à jour le 17/08/2026 · Description du profil : Profil : Femme salariée de 40 ans, mariée, avec deux enfants — un de 10 ans (né le 01/01/2016) et un de 15 ans (né le 01/01/2011) —, vivant à Lille. Tous affiliés au régime général de la sécurité sociale. · Classement basé sur le prix · Référencement gratuit, sans incidence sur l'ordre d'affichage · Sélection non exhaustive parmi les assureurs comparés par Selectra

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Mis à jour le 20/08/2026 · Description du profil : Profil : Femme étudiante célibataire de 22 ans, sans enfant, vivant à Lille. Affiliée au régime général de la sécurité sociale. · Classement basé sur le prix · Référencement gratuit, sans incidence sur l'ordre d'affichage · Sélection non exhaustive parmi les assureurs comparés par Selectra

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Mis à jour le 20/08/2026 · Description du profil : Profil : Femme retraitée de 65 ans, célibataire, sans enfant, vivant à Lille. Affiliée au régime général de la sécurité sociale. · Classement basé sur le prix · Référencement gratuit, sans incidence sur l'ordre d'affichage · Sélection non exhaustive parmi les assureurs comparés par Selectra

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    Selectra Score B
    63,33 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : Non couvert
    En savoir plus

    Détail des garanties · 28 lignes

  2. Logo Alan
    Alan

    Senior Essentiel

    Économique
    Selectra Score B
    78,00 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 120 % Optique : Non couvert Dentaire : 150 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 33 lignes

  3. Logo Direct Assurance
    Direct Assurance

    ESSENTIELLE

    Économique Partenaire
    Selectra Score B
    80,76 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : 100 %
    Je choisis

    Détail des garanties · 31 lignes

  1. Logo SMENO
    SMENO

    Mut M

    Économique
    Selectra Score B
    63,33 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : Non couvert
    En savoir plus

    Détail des garanties · 28 lignes

  2. Logo Alan
    Alan

    Senior Essentiel

    Économique
    Selectra Score B
    78,00 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 120 % Optique : Non couvert Dentaire : 150 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 33 lignes

  3. Logo Direct Assurance
    Direct Assurance

    ESSENTIELLE

    Économique Partenaire
    Selectra Score B
    80,76 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : 100 %
    Je choisis

    Détail des garanties · 31 lignes

  1. Logo Malakoff Humanis
    Malakoff Humanis

    Intermédiaire

    Équilibré Partenaire
    Selectra Score A
    106,79 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 120 % Optique : 230 € Dentaire : 500 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 47 lignes

  2. Logo MGC
    MGC

    Zen

    Équilibré
    Selectra Score A
    110,13 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 100 % Optique : 160 € Dentaire : 1 000 €
    En savoir plus

    Détail des garanties · 54 lignes

  3. Logo APICIL
    APICIL

    Sérénité 1

    Équilibré
    Selectra Score B
    119,80 €/mois
    Hospitalisation : 150 % Soins courants : 150 % Optique : 250 € Dentaire : 500 €
    En savoir plus

    Détail des garanties · 40 lignes

  1. Logo HEYME
    HEYME

    Jade

    Premium Partenaire
    Selectra Score B
    149,67 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 200 % Optique : 400 € Dentaire : 1 800 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 49 lignes

  2. Logo Alan
    Alan

    Senior Privilège

    Premium
    Selectra Score C
    175,00 €/mois
    Hospitalisation : 300 % Soins courants : 350 % Optique : 450 € Dentaire : 320 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 46 lignes

  3. Logo Direct Assurance
    Direct Assurance

    BIEN-ÊTRE +

    Premium Partenaire
    Selectra Score C
    177,97 €/mois
    Hospitalisation : 205 % Soins courants : 205 % Optique : 500 € Dentaire : 1 600 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 54 lignes

Mis à jour le 20/08/2026 · Description du profil : Profil : Femme retraitée de 75 ans, célibataire, sans enfant, vivant à Lille. Affiliée au régime général de la sécurité sociale. · Classement basé sur le prix · Référencement gratuit, sans incidence sur l'ordre d'affichage · Sélection non exhaustive parmi les assureurs comparés par Selectra

  1. Logo SMENO
    SMENO

    Mut M

    Économique
    Selectra Score B
    63,33 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : Non couvert
    En savoir plus

    Détail des garanties · 28 lignes

  2. Logo Malakoff Humanis
    Malakoff Humanis

    Initial

    Économique Partenaire
    Selectra Score B
    101,40 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 100 % Dentaire : 100 %
    Je choisis

    Détail des garanties · 36 lignes

  3. Logo MGC
    MGC

    Zen Éco

    Économique
    Selectra Score A
    104,43 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 190 € Dentaire : 100 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 48 lignes

  1. Logo SMENO
    SMENO

    Mut M

    Économique
    Selectra Score B
    63,33 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : Non couvert
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    Détail des garanties · 28 lignes

  2. Logo Malakoff Humanis
    Malakoff Humanis

    Initial

    Économique Partenaire
    Selectra Score B
    101,40 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 100 % Dentaire : 100 %
    Je choisis

    Détail des garanties · 36 lignes

  3. Logo MGC
    MGC

    Zen Éco

    Économique
    Selectra Score A
    104,43 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 190 € Dentaire : 100 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 48 lignes

  1. Logo MGC
    MGC

    Zen

    Équilibré
    Selectra Score A
    119,58 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 100 % Optique : 160 € Dentaire : 1 000 €
    En savoir plus

    Détail des garanties · 54 lignes

  2. Logo Malakoff Humanis
    Malakoff Humanis

    Intermédiaire

    Équilibré Partenaire
    Selectra Score A
    138,06 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 120 % Optique : 230 € Dentaire : 500 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 47 lignes

  3. Logo APICIL
    APICIL

    Sérénité 1

    Équilibré
    Selectra Score B
    145,76 €/mois
    Hospitalisation : 150 % Soins courants : 150 % Optique : 250 € Dentaire : 500 €
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    Détail des garanties · 40 lignes

  1. Logo HEYME
    HEYME

    Jade

    Premium Partenaire
    Selectra Score B
    188,75 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 200 % Optique : 400 € Dentaire : 1 800 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 49 lignes

  2. Logo MGC
    MGC

    Zen Extra

    Premium
    Selectra Score C
    204,02 €/mois
    Hospitalisation : 300 % Soins courants : 250 % Optique : 260 € Dentaire : 1 600 €
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    Détail des garanties · 55 lignes

  3. Logo Harmonie Mutuelle
    Harmonie Mutuelle

    Protection Santé PSI331

    Premium
    Selectra Score D
    244,09 €/mois
    Hospitalisation : 190 % Soins courants : 140 % Optique : 420 € Dentaire : 400 €
    En savoir plus

    Détail des garanties · 53 lignes

Mis à jour le 20/08/2026 · Description du profil : Profil : Femme retraitée de 85 ans, célibataire, sans enfant, vivant à Lille. Affiliée au régime général de la sécurité sociale. · Classement basé sur le prix · Référencement gratuit, sans incidence sur l'ordre d'affichage · Sélection non exhaustive parmi les assureurs comparés par Selectra

  1. Logo SMENO
    SMENO

    Mut M

    Économique
    Selectra Score B
    63,33 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : Non couvert
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    Détail des garanties · 28 lignes

  2. Logo MGC
    MGC

    Zen Éco

    Économique
    Selectra Score A
    104,43 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 190 € Dentaire : 100 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 48 lignes

  3. Logo HEYME
    HEYME

    Ambre

    Économique Partenaire
    Selectra Score A
    116,32 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 275 € Dentaire : 1 200 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 43 lignes

  1. Logo SMENO
    SMENO

    Mut M

    Économique
    Selectra Score B
    63,33 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : Non couvert
    En savoir plus

    Détail des garanties · 28 lignes

  2. Logo MGC
    MGC

    Zen Éco

    Économique
    Selectra Score A
    104,43 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 190 € Dentaire : 100 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 48 lignes

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    HEYME

    Ambre

    Économique Partenaire
    Selectra Score A
    116,32 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 275 € Dentaire : 1 200 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 43 lignes

  1. Logo MGC
    MGC

    Zen

    Équilibré
    Selectra Score A
    119,58 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 100 % Optique : 160 € Dentaire : 1 000 €
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    Détail des garanties · 54 lignes

  2. Logo Matmut
    Matmut

    Corps 2 + Tête 2

    Équilibré
    Selectra Score B
    183,07 €/mois
    Hospitalisation : 125 % Soins courants : 125 % Optique : 250 € Dentaire : 150 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 56 lignes

  3. Logo Harmonie Mutuelle
    Harmonie Mutuelle

    Protection Santé PSI221

    Équilibré
    Selectra Score B
    189,68 €/mois
    Hospitalisation : 150 % Soins courants : 100 % Optique : 170 € Dentaire : 200 €
    En savoir plus

    Détail des garanties · 52 lignes

  1. Logo HEYME
    HEYME

    Jade

    Premium Partenaire
    Selectra Score A
    188,75 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 200 % Optique : 400 € Dentaire : 1 800 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 49 lignes

  2. Logo MGC
    MGC

    Zen Extra

    Premium
    Selectra Score A
    204,02 €/mois
    Hospitalisation : 300 % Soins courants : 250 % Optique : 260 € Dentaire : 1 600 €
    En savoir plus

    Détail des garanties · 55 lignes

  3. Logo Harmonie Mutuelle
    Harmonie Mutuelle

    Protection Santé PSI331

    Premium
    Selectra Score C
    248,45 €/mois
    Hospitalisation : 190 % Soins courants : 140 % Optique : 420 € Dentaire : 400 €
    En savoir plus

    Détail des garanties · 53 lignes

Mis à jour le 20/08/2026 · Description du profil : Profil : Femme retraitée de 92 ans, célibataire, sans enfant, vivant à Lille. Affiliée au régime général de la sécurité sociale. · Classement basé sur le prix · Référencement gratuit, sans incidence sur l'ordre d'affichage · Sélection non exhaustive parmi les assureurs comparés par Selectra

  1. Logo SMENO
    SMENO

    Mut M

    Économique
    Selectra Score B
    23,80 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : Non couvert
    En savoir plus

    Détail des garanties · 28 lignes

  2. Logo MAAF
    MAAF

    Besoin 1

    Économique
    Selectra Score B
    23,89 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 200 € Dentaire : 100 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 29 lignes

  3. Logo Lovys
    Lovys

    Essentielle

    Économique
    Selectra Score B
    27,07 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : 100 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 24 lignes

  1. Logo SMENO
    SMENO

    Mut M

    Économique
    Selectra Score B
    23,80 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : Non couvert
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    Détail des garanties · 28 lignes

  2. Logo MAAF
    MAAF

    Besoin 1

    Économique
    Selectra Score B
    23,89 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : 200 € Dentaire : 100 %
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    Détail des garanties · 29 lignes

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    Lovys

    Essentielle

    Économique
    Selectra Score B
    27,07 €/mois
    Hospitalisation : 100 % Soins courants : 100 % Optique : Non couvert Dentaire : 100 %
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    Détail des garanties · 24 lignes

  1. Logo Alan
    Alan

    Rubis

    Équilibré
    Selectra Score A
    46,00 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 120 % Optique : 225 € Dentaire : 125 %
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    Détail des garanties · 42 lignes

  2. Logo Malakoff Humanis
    Malakoff Humanis

    Intermédiaire

    Équilibré Partenaire
    Selectra Score A
    46,88 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 120 % Optique : 230 € Dentaire : 500 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 47 lignes

  3. Logo Direct Assurance
    Direct Assurance

    LIBERTÉ +

    Équilibré Partenaire
    Selectra Score B
    51,16 €/mois
    Hospitalisation : 160 % Soins courants : 160 % Optique : 300 € Dentaire : 1 400 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 49 lignes

  1. Logo MGC
    MGC

    Indépendants Niveau 2

    Premium
    Selectra Score A
    53,89 €/mois
    Hospitalisation : 200 % Soins courants : 200 % Optique : 170 € Dentaire : Frais réels
    En savoir plus

    Détail des garanties · 53 lignes

  2. Logo Harmonie Mutuelle
    Harmonie Mutuelle

    Pro 3-4

    Premium
    Selectra Score B
    67,39 €/mois
    Hospitalisation : 300 % Soins courants : 250 % Optique : 350 € Dentaire : 550 %
    En savoir plus

    Détail des garanties · 52 lignes

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    Direct Assurance

    BIEN-ÊTRE +

    Premium Partenaire
    Selectra Score C
    72,93 €/mois
    Hospitalisation : 205 % Soins courants : 205 % Optique : 500 € Dentaire : 1 600 €
    Je choisis

    Détail des garanties · 54 lignes

Mis à jour le 17/08/2026 · Classement basé sur le prix · Référencement gratuit, sans incidence sur l'ordre d'affichage · Sélection non exhaustive parmi les assureurs comparés par Selectra

Deux lignes méritent une lecture attentive avant la signature : le délai de carence, pendant lequel aucune prestation n'est versée, et la liste des exclusions. Un contrat de complémentaire santé se juge sur ces deux points autant que sur sa cotisation mensuelle.

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